fMRI klinisk

Den första MPRAGE‐sekvensen används för realtidsutvädering av fMRI (OMplan,

liksom alla fMRI‐sekvenser). Alla fMRI‐sekvenserna är identiska, men

namngivningen föjer med i slutanalys. Väj de sekvenser som motsvarar de

begärda paradigmen enligt remiss.

MRI‐sekvenserna, samt “1_mprage_tra_p2_iso_1.0_ivk_rakt”ska skickas till Q:/

för vidare analys med fMRI‐batchen (separat manual). Örigt skickas till PACS.

Förberedelser:

• Starta projektor I US‐rum
• Starta E‐primedatorn. Paradigm ligger på skrivbordet under mappen “kliniska paradigm” Det finns tre paradigm att väja på: “motorik” “bilda ord”och “verb till subst” Dubbelklicka på rätt fil för att öpna paradigmet i E‐prime. Klicka sedan på ikonen med en lila springande figure (“Run”) för att köra paradigmet.
• De dialogrutor som sedan visas kan ignoreras genom att svara “Yes” på alla frågor.
• För motorikparadigmet kommer skärmen att visa en instruktionsskärm med avslutande text: “Väntar på att kameran startar”. Härifrån kan pulssekvensen startas. Paradigmet kommer att fortsätta automatiskt genom triggning från kameran.
• För språkparadigm gäller samma princip, men i dessa finns flera instruktionsskärmar, samt ett övningsblock som kan upprepas vid behov. För att visa nästkommande skärm, kan valfri tangent tryckas ned.

Körning/realtidsutvärdering:
Med applikationen “Neuro 3D” kan automatisk analys av data genomföras medan pulssekvensen körs. Mjukvaran använder den först körda MPRAGE-sekvensen som underlag.

• Starta Neuro 3D-applikationen (Applications->Neuro 3D)
• Ladda MPRAGE-sekvens från “Patient Browser”. Dra den körda sekvensen (T1_mprage_tra_p2_iso_1.0_OM-plan) från browsern till Neuro 3D-rutan.
• Starta “Inline Mode” (blå play-knapp) 
• Svara “Yes” på frågan “Do you want to enter the inline Mode without Fieldmap?”
• Starta pulssekvensen. Återvänd till Neuro 3D för att se realtidsutvärderingen.
• Starta “Evaluation mode” med ikonen . Denna öppnar ett fönster i samma ruta som den transversella projektionen av MPRAGE-sekvensen ligger. Med detta verktyg kan patientrörelse övervakas. Den övre grafen visar signal i ett ROI (används ej kliniskt). De två understa graferna visar translation resp. rotation. Tre kurvor kommer att ritas upp i båda dessa grafer, visande magnituden av translationen/rotationen. Om dessa är kraftigt varierande och når upp till “1” (motsvarar 1 mm translation eller 1 grads rotation) kan paradigmet behöva köras om, men inspektera även ev. aktivering innan paradigmet körs om.
• Då den transversella projektionen oftast är den lättaste att använda för bedömning, kan man skifta mellan MR-bild och “Evaluation mode” genom att klicka på upprepade gånger.    

              Evalution Mode        

• Det tar ca. 30 s innan man kan se ev. aktivering (motsvarande ett block av aktivering/vila)
• För att ställa statistisk tröskel: Öppna trösklingsverktyget (Visual –>Functional Properties). Justera tröskeln genom att dra i reglaget i översta panelen (röd oval i bild nedan). Sätt tröskel till ca. 3, vilket borde ge aktivering. Man kan sänka tröskeln till ca. 2, men detta ska ej medföra spridd aktivering i stora delar av hjärnan. Den gul-röda skalan visar positiv aktivering, medan den blå-gröna visar negativ aktivering. Den senare är normalt ointressant och kan döljas genom att dra reglaget långt åt vänster för denna (klicka på rutan mitt emellan de två skalorna för att kunna reglera dom individuellt). 
   
•  I trösklingsverktyget kan även filter för klusterstorlek ställas in (More >> Activation Map Filter Clustering Size). Genom att sätta denna till 10-20, plockas enstaka - troligen falska - aktiverade voxlar bort (blå oval i bild nedan).

    Functional Properties

Alla fMRI‐sekvenserna är identiska, men namngivningen föjer med i slutanalys (om du kör om en sekvens, döp den till nr 2).

Väj de sekvenser som motsvarar det begärda paradigmet/en enligt remiss.

Alla sekvenser ska skickas till PACS för vidare analys med fMRI‐batchen via Brainex (separat manual).

T1_mprage_tra_p2_iso_1.0_ivk_rakt ska även skickas till Stealthplan.

Förberedelser:

Om patienten ser dåligt, låna glasögon på 7T nere i källaren.

• Stäng av musik.
• Starta TV skärm inne på Us rummet; tryck on på det fyrkantiga batteriet ute i manöverrummet.

• Starta paradigmdatorn (E‐primedatorn). Lösenordet står på skärmfoten.

• Öppna mappen "kliniska paradigm".

• Dubbelklicka på rätt paradigm (står i remissen) för att öppna programmet i E‐prime.
• Svara “Yes” på alla frågor som kommer upp i dialogrutor.

Det finns olika paradigm att väja på:

“motorik” “bilda ord”, "sensorisk" och “verb till subst” .

Motorikparadigm: skärmen kommer att visa en instruktionsskärm med avslutande text: “Väntar på att kameran startar”. Paradigmet kommer att fortsätta automatiskt när sekvensen startas via triggning från kameran.

Det kommer stå start och stop för aktivitet och vila.

Språkparadigm: gäller samma princip, men i dessa finns flera instruktionsskärmar, samt ett övningsblock som kan upprepas vid behov. Tryck på valfri tangent för att visa nästkommande skärm med instruktion.

Informera patienten om vad paradigmet går ut på. Glöm inte informera om paussymbolen (olika för olika paradigm).

Bilda ord                     – tänk på så många ord som möjligt på den bokstav som visas.

                                     Om pat har problem att komma på flera ord ska pat tänka på samma ord.

Substantiv till verb       – vad kan du göra med ex en boll.

Sensorisk                    – ta en disksvamp och dra längst med undersidan av foten alt handen.

Motorisk                      – Hand: pat. Ska vid start omväxlande röra med handens fingertoppar mot tummen.

                                     Fot: vifta på tårna alt foten. Fixera ev pats. ben med en hand. 

Körning/realtidsutvärdering:

1. Planera din sekvens (fMRI sekvenser ska ligga i OM plan).
2. Starta sekvensen -den kommer shimma, sen dyker continue rutan upp. Om det är ett paradigm med övningsrunda kan du starta den nu. Annars informerar du patienten att vi börjar köra funktionsundersökningen.
3. Tryck på continue. paradigmet triggas igång automatiskt.

Du kan inte ändra tröskelvärdet på VIDA men du kan följa aktiveringen om du tar upp inline-display. Det kan ge dig en hänvisning om att patienten har förstått och gör rätt. Se bild 1-3 under Efterarbete nedan för att se vilka områden i hjärnan där aktivitet ska synas bereonde på aktivitet. I början kommer det att lysa upp flera röda områden, detta ska förhoppningsvis avta ju längre patienten aktiverar området.

Problem: Om pat rör sig mycket kan det bli mycket aktivering/spridd aktivering.

Peter Mannfolk är gärna med när vi kör fMRI.